Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
MpdzQ8VBX6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
MpdzQ8VBX6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms