Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Brd8Q8R3B7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Brd8Q8R3B7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms