Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Hecw1Q8K4P8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms