Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cdk5rap2Q8K389 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cdk5rap2Q8K389 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms