Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ncapd2Q8K2Z4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms