Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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Trappc12Q8K2L8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
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Trappc12Q8K2L8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trappc12Q8K2L8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
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Trappc12Q8K2L8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Trappc12Q8K2L8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Trappc12Q8K2L8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
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Trappc12Q8K2L8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Trappc12Q8K2L8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Trappc12Q8K2L8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
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Trappc12Q8K2L8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trappc12Q8K2L8 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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