Protein–RNA interactions for Protein: Q8K202

Polr1e, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1eQ8K202 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Polr1eQ8K202 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Polr1eQ8K202 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms