Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1J5

Sde2, Replication stress response regulator SDE2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sde2Q8K1J5 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sde2Q8K1J5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sde2Q8K1J5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms