Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0E8

Fgb, Fibrinogen beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgbQ8K0E8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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FgbQ8K0E8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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FgbQ8K0E8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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FgbQ8K0E8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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FgbQ8K0E8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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FgbQ8K0E8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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FgbQ8K0E8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FgbQ8K0E8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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FgbQ8K0E8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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FgbQ8K0E8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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FgbQ8K0E8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FgbQ8K0E8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms