Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Pkn3Q8K045 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms