Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Znf628Q8CJ78 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Znf628Q8CJ78 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms