Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TwnkQ8CIW5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TwnkQ8CIW5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms