Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SbsnQ8CIT9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
SbsnQ8CIT9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.1 ms