Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc17Q8CE13 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc17Q8CE13 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms