Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Lrrn3Q8CBC6 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrn3Q8CBC6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrn3Q8CBC6 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrn3Q8CBC6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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Lrrn3Q8CBC6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Lrrn3Q8CBC6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Lrrn3Q8CBC6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Lrrn3Q8CBC6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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Lrrn3Q8CBC6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Lrrn3Q8CBC6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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