Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3B8

Rft1, Protein RFT1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rft1Q8C3B8 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rft1Q8C3B8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rft1Q8C3B8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms