Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Usp47Q8BY87 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Usp47Q8BY87 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
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