Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX32

Slx1b, Structure-specific endonuclease subunit SLX1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx1bQ8BX32 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slx1bQ8BX32 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slx1bQ8BX32 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms