Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ube3dQ8BX13 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Ube3dQ8BX13 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ube3dQ8BX13 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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Ube3dQ8BX13 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ube3dQ8BX13 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
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