Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ctdsp2Q8BX07 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ctdsp2Q8BX07 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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