Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
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Usp38Q8BW70 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Usp38Q8BW70 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Usp38Q8BW70 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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Usp38Q8BW70 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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Usp38Q8BW70 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Usp38Q8BW70 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Usp38Q8BW70 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Usp38Q8BW70 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Usp38Q8BW70 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Usp38Q8BW70 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Usp38Q8BW70 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Usp38Q8BW70 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Usp38Q8BW70 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Usp38Q8BW70 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Usp38Q8BW70 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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Usp38Q8BW70 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp38Q8BW70 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms