Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTE0

Sdhaf4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdhaf4Q8BTE0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdhaf4Q8BTE0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdhaf4Q8BTE0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdhaf4Q8BTE0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdhaf4Q8BTE0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdhaf4Q8BTE0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdhaf4Q8BTE0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdhaf4Q8BTE0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdhaf4Q8BTE0 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Sdhaf4Q8BTE0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sdhaf4Q8BTE0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms