Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKT6

Tspan12, Tetraspanin-12, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan12Q8BKT6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tspan12Q8BKT6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tspan12Q8BKT6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tspan12Q8BKT6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tspan12Q8BKT6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tspan12Q8BKT6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms