Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tnrc6bQ8BKI2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Tnrc6bQ8BKI2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms