Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Atg4bQ8BGE6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg4bQ8BGE6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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