Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
H2-M10.4Q85ZW8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms