Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
NfascQ810U3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
NfascQ810U3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms