Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc172Q810N9 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc172Q810N9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms