Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Liat1Q810M6 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Liat1Q810M6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms