Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ChfrQ810L3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ChfrQ810L3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms