Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pcsk9Q80W65 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Pcsk9Q80W65 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pcsk9Q80W65 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pcsk9Q80W65 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Pcsk9Q80W65 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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