Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccdc155Q80VJ8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccdc155Q80VJ8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms