Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ttll4Q80UG8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ttll4Q80UG8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms