Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC37.14■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC37.14■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
NischQ80TM9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC37.09■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
NischQ80TM9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC37.05■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
NischQ80TM9 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms