Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSQ1

Clec18a, C-type lectin domain family 18 member A, mousemouse

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec18aQ7TSQ1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Clec18aQ7TSQ1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Clec18aQ7TSQ1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms