Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ShprhQ7TPQ3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ShprhQ7TPQ3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ShprhQ7TPQ3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ShprhQ7TPQ3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ShprhQ7TPQ3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ShprhQ7TPQ3 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ShprhQ7TPQ3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ShprhQ7TPQ3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ShprhQ7TPQ3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ShprhQ7TPQ3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms