Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prrc2bQ7TPM1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prrc2bQ7TPM1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms