Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms