Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SynmQ70IV5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SynmQ70IV5 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms