Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWU9

Rps27, 40S ribosomal protein S27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps27Q6ZWU9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rps27Q6ZWU9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps27Q6ZWU9 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps27Q6ZWU9 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rps27Q6ZWU9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps27Q6ZWU9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rps27Q6ZWU9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms