Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQE4

Nemp1, Nuclear envelope integral membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nemp1Q6ZQE4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nemp1Q6ZQE4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms