Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPV2

Ino80, DNA helicase INO80, mousemouse

Predictions only

Length 1,559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80Q6ZPV2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ino80Q6ZPV2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ino80Q6ZPV2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms