Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Slc9c1Q6UJY2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Slc9c1Q6UJY2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc9c1Q6UJY2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Slc9c1Q6UJY2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9c1Q6UJY2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9c1Q6UJY2 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Slc9c1Q6UJY2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms