Protein–RNA interactions for Protein: Q6RUU0

Ptx4, Pentraxin-4, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptx4Q6RUU0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ptx4Q6RUU0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Ptx4Q6RUU0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms