Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNU9

Tlr12, Toll-like receptor 12, mousemouse

Predictions only

Length 906 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr12Q6QNU9 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Tlr12Q6QNU9 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr12Q6QNU9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr12Q6QNU9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr12Q6QNU9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr12Q6QNU9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr12Q6QNU9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr12Q6QNU9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr12Q6QNU9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr12Q6QNU9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Tlr12Q6QNU9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms