Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIP5

Nudcd1, NudC domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd1Q6PIP5 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Nudcd1Q6PIP5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Nudcd1Q6PIP5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.4 ms