Protein–RNA interactions for Protein: Q6PGC7

Slc35e3, Solute carrier family 35 member E3, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc35e3Q6PGC7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Slc35e3Q6PGC7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Slc35e3Q6PGC7 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35e3Q6PGC7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35e3Q6PGC7 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35e3Q6PGC7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Slc35e3Q6PGC7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Slc35e3Q6PGC7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms