Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE3

Rad54b, DNA repair and recombination protein RAD54B, mousemouse

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad54bQ6PFE3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Rad54bQ6PFE3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rad54bQ6PFE3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms