Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE3

Rrm2b, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2 B, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrm2bQ6PEE3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rrm2bQ6PEE3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrm2bQ6PEE3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms