Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDM4

Ccdc36, Interactor of HORMAD1 protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc36Q6PDM4 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc36Q6PDM4 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ccdc36Q6PDM4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc36Q6PDM4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms